根據2014 年《中國環境狀況公報》：全國423 條主要河流、62 座重點湖泊（水庫）的968 個國控地表水監測斷面（點位）開展了水質監測，Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ、劣Ⅴ類水質斷面分別占3.4%、30.4%、29.3%、20.9%、6.8%、9.2%，主要污染指標為化學需氧量、總磷和五日生化需氧量。對比來看，北方地區污染程度較重，治理需求大。
2014 年七大流域和浙閩片河流、西北諸河、西南諸河水質狀況
另外，《中國環境狀況公報》還顯示，某些流域的干流、支流水質情況差異較大，尤其是支流方面，污染情況更為嚴重，如淮河干流水質全年都在Ⅳ類水以上，但主要支流的劣Ⅴ類水體超過23%;在各大水系中海河的劣Ⅴ類水質程度最高，國控斷面監測數據表明，干流劣Ⅴ類達37%、支流劣Ⅴ類達44%。
所謂“黑臭”，主要屬于環境景觀、物理指標范疇，是指在視覺上河流水體呈現因污染而產生的明顯異常顏色（通常是黑色或泛黑色），同時產生在嗅覺上引起人們感覺不適甚至厭惡的氣味，是水體感官性污染最常見的一種現象。
中國產業信息網發布的《2015-2020年中國污水處理行業運行態勢及投資戰略研究報告》指出：我國河流黑臭現象最早出現在上海蘇州河，隨后南京的秦淮河、蘇州的外城河、武漢的黃孝河和寧波的內河等，均出現不同程度的黑臭現象。近幾十年來，黑臭水體的范圍和程度不斷加劇，在全國大部分城市河段中，流經繁華區域的水體絕大部分受到不同程度的污染，尤其是各大流域的事級與三級支流的黑臭問題更加突出，且劣化程度逐年提高。
據統計，我國城鎮仍有約20%的污水直排和溢流，這是造成河湖黑臭問題80%的主要癥結，這20%的污水包括污水處理廠的溢流水、分散點源污水、管網待壓溢流污水、雨污河流制面源污水等。我國的水污染控制和治理措施滯后于城市化和工業化迚程，導致城鎮河流等水體直接成為工業、農業及生活廢水的主要排放通道和場所，水體吸納的污染量超過自身自凈能力，造成大面積受污染，水體逐漸富營養化，形成黑臭水體，如此情景在部分中小城市中尤為普遍。
黑臭水體治理難點：死水活化難、底泥清理難、污染源截污難。
“由清變黑易，由差變好難”：對于生態功能碎片化的水體，水流溝通難度大，要使其流動起來需要耗費大量的人力、物力、財力，否則，即使經過截污、技術處理、底泥疏浚消除黑臭，水體在不流動的情況下，大氣中污染物沉降也極易再次造成水體污染，管理不到位會很快反彈。
底泥疏浚工程浩大：長年累月的黑臭水體在河流底部積累了大量的淤泥，有些淤泥厚達1——2米，其中含有大量的污染物、有機物、無機物等，疏浚清淤工程浩大；大量的淤泥從河道挖出后無處存放，處于“不清污染，清則無處安放”的處置兩難境地。
截污治污難：治污難點在于點多面廣成分復雜，仸務重能力低下，污水收集治理能力不足，管網不配套，甚至很多大中城市污水收集系統不完善，如目前深圳還缺少5000 公里左右污水收集管網，城市每天有90 萬噸污水未經處理直排入水環境。
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